Muzeum Papieskie umiejscowione jest w pomieszczeniu, w którym podczas uroczystości kanonizacyjnych błogosławionej Kingi, znajdowała się zakrystia. Zobaczyć w nim można fragmenty albumu pt. „Ojciec Święty na Sądeckiej Ziemi”, autorstwa Sylwestra Adamczyka, wyroby artystyczne przedstawiające papieża i Kingę, meble z Mszy Św. Kanonizacyjnej, tron papieski czy ambonę. Zobaczyć można także pamiątki po Janie Pawle II (ekwipunek, z jakiego korzystał podczas górskich wypraw, płyty CD, karty wejścia na spotkania z papieżem, okolicznościowe medale).