Kościół św. Franciszka z Asyżu w kompleksie klasztornym franciszkanów znajduje się przy Starym Mieście w Krakowie, w pobliżu ulicy Grodzkiej. W jego sąsiedztwie znajdują się zabudowania kurii krakowskiej, gdzie znajduje się słynne okno papieskie.

Klasztor franciszkanów w Krakowie został założony w 1236 r. Pierwotny kościół został przebudowany w drugiej połowie XIII w. na polecenie Bolesława Wstydliwego i w zamyśle miał służyć jako mauzoleum księcia i jego żony Kingi. Druga rozbudowa w stylu dojrzałego gotyku miała miejsce w XV w. Powstała w ten sposób bryła, którą można oglądać do dziś. Jest to jednonawowy, gotycki kościół z transeptem oraz trzema kaplicami bocznymi wzniesiony z cegły i przylegający do zabudowań klasztornych.

Wnętrze kościoła ma wystrój pochodzący z drugiej połowy XIX w. Zostało stworzone przez krakowskich artystów po pożarze z 1850 r. Projekty do witraży, w tym słynnego witraża Bóg Ojciec stworzył Stanisław Wyspiański. Na ścianach prezbiterium i transeptu znajdują się także jego polichromie. Malowidła w nawie namalował z kolei Tadeusz Popiel, a Jan Matejko wykonał projekt płytę z sylwetką księcia Bolesława Wstydliwego umieszczoną przed ołtarzem głównym.